Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC140449.1-201ENSMUST00000214600 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox12Q04890 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms