Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ces2b-201ENSMUST00000059449 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GscQ02591 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GscQ02591 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GscQ02591 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms