Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoa1Q00623 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms