Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms