Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx1P81068 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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