Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Glb1l2-202ENSMUST00000066560 3688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm44815-201ENSMUST00000206812 1633 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr531-202ENSMUST00000216053 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pm20d1-201ENSMUST00000048660 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Aldh1l1-201ENSMUST00000032175 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Metap2-210ENSMUST00000181217 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Sez6l-203ENSMUST00000197425 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gnpda2-206ENSMUST00000166298 1755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm45205-201ENSMUST00000205745 3330 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Xpnpep2-202ENSMUST00000114998 3017 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Stam-201ENSMUST00000028050 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Irx2P81066 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms