Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gfi1P70338 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1P70338 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms