Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CntfP51642 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CntfP51642 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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