Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms