Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp4P35123 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp4P35123 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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