Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms