Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18533 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18533 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18533 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms