Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms