Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm38340-201ENSMUST00000195039 4008 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms