Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms