Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01676 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01676 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01676 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P01676 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01676 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01676 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01676 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01676 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01676 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01676 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01676 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01676 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms