Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
XntrpcF8VQM8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XntrpcF8VQM8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms