Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms