Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Fhl3Q9R059 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms