Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChmQ9QXG2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms