Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclk1Q9JLM8 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm13592-201ENSMUST00000118148 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dclk1Q9JLM8 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms