Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pole3Q9JKP7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms