Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
OtofQ9ESF1 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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