Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ociad1-204ENSMUST00000200935 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 BC018473-201ENSMUST00000132056 1331 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 2310015K22Rik-201ENSMUST00000191452 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms