Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf17Q99MV7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf17Q99MV7 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rnf17Q99MV7 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf17Q99MV7 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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