Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ubxn4Q8VCH8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms