Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd4aQ8CBY1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms