Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CntrobQ8CB62 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CntrobQ8CB62 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms