Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Q8BGC1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms