Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf187Q8BFX1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms