Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms