Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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