Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb3Q6XAS4 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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