Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HltfQ6PCN7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms