Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnna3Q65CL1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms