Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms