Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atp2b3Q0VF55 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms