Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm8091-201ENSMUST00000150506 886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Pip5k1bos-201ENSMUST00000126936 684 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Slco4a1-201ENSMUST00000038225 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrioQ0KL02 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms