Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms