Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GscQ02591 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms