Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

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Length 1,482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Grin2bQ01097 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Grin2bQ01097 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Grin2bQ01097 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Grin2bQ01097 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Grin2bQ01097 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Grin2bQ01097 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms