Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms