Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Hoxd13P70217 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Hoxd13P70217 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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