Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Sh3bp1P55194 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sh3bp1P55194 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sh3bp1P55194 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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