Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdkn1bP46414 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms