Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa10P31310 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms