Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms