Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms