Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18530 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms