Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Defa-rs1P17533 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Defa-rs1P17533 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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